レジオネラ属菌は、バイオフィルム2)（生物膜）中のアメーバ類等の原生動物へ寄生して増殖し、そこから水中に移行します。したがって、バイオフィルムを物理的、化学的に除去することによりレジオネラ属菌の供給源を絶つことができます。

2) バイオフィルムとは壁面や床面などに付着した微生物が増殖するとともに、粘性物質を体外に産生し、これらや微生物の死骸が混在、結合して形成されたもので、「ぬめり」と表現されることもあります。

以下に有効な手順の例を示します。
（１）責任者、清掃担当者など、チーム内で情報共有を図ります。
（２）清掃方法を確認し、再度、清掃を行います。塩素消毒をしている場合は、塩素濃度の確認も併せて行います。
（３）清掃後、再度、検査を行います。その際、補給湯（浴槽への注ぎ湯など）・水（加水している場合）の検査も併せて行うことが望ましい。上流へのさかのぼり検査を行うことにより、問題点を明確にすることができます。
（４）洗浄・消毒方法の見直し、浴槽壁等の損傷の有無の確認、付随設備の確認、記録簿による塩素濃度の確認、消毒装置の点検など、原因の究明を行います。
（５）対応の内容を記録しておきます。